Masjid adalah rumah tempat ibadah umat Muslim. Masjid artinya tempat sujud, dan Masjid berukuran kecil juga disebut mushollalanggar atau surau. Selain tempat ibadah masjid juga merupakan pusat kehidupan komunitas muslim. Kegiatan – kegiatan perayaan hari besar, diskusi, kajian agama, ceramah dan belajar Al Qur’an sering dilaksanakan di Masjid.

Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan memiliki sarana yaitu Musholla dengan luas 109,2 m2 guna menunjang aktivitas keagamaan untuk civitas akademika di lingkungan Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan.